همانگونه که در پست قبلی گفته شد، اکثر موارد آنسفالیت به علت عفونتهای ویروسی بروز میکند. ویروسهای مختلفی میتوانند باعث بروز آنسفالیت شوند. در زیر به برخی از این عوامل اشاره میشود.
ویروس هرپس سیمپلکس شامل ویروس هرپس سیمپلکس نوع ۱ و نوع ۲ است. هر دو نوع این ویروسها میتوانند باعث آنسفالیت شوند. ویروس هرپس نوع ۱ بهندرت باعث آنسفالیت میشود، ولی در مواردی که آنسفالیت به علت این ویروس بروز میکند، میتواند آسیب مغزی شدید و یا مرگ را به دنبال داشته باشد.

Image credit: mmcneuro.wordpress.com
سایر انواع هرپس ویروس شامل ویروس اپشتاین‑بار هستند که باعث بروز منونوکلئوز عفونی میشود، و ویروس آبلهمرغان که عموماً باعث آبلهمرغان و زونا میشود. این ویروسها نیز میتوانند در موارد کمتری ایجاد آنسفالیت کنند.
آنتروویروسها شامل ویروس پولیو و ویروس کوکساکی هستند. علایم این ویروسها بهصورت بیماری آنفولانزا است، و باعث التهاب چشم و درد شکم نیز میشود. این ویروسها نیز از مواردی هستند که میتوانند علایم آنسفالیت ایجاد کنند.
ویروسهای منتقله از راه پشه، باعث عفونتهایی مانند نیل غربی آنسفالیت اسبی غربی و شرقی میشوند. علایم عفونت چند روز تا دو هفته بعد از تماس با ویروس منتقله از راه پشه شروع میشود.
ویروسهای منتقله از راه کنه گروهی دیگر از ویروسها هستند که از طریق کنه انتقال پیدا میکنند و میتوانند باعث بروز آنسفالیت شوند. در این موارد، علایم بیماری معمولاً حدود یک هفته بعد از گزش کنهی مبتلا ظاهر میشود.
ویروس هاری نیز یکی از عواملی است که ضمن انتقال بیماری هاری، میتواند آنسفالیت ایجاد کند. ویروس هاری معمولاً از طریق گزش حیوان مبتلا انتقال پیدا میکند و پس از شروع علایم هاری، بهسرعت به سمت آنسفالیت پیشرفت میکند. هاری امروزه از علل نادر آنسفالیت محسوب میشود.
عفونتهای دوران کودکی، از قبیل سرخک، اوریون، و سرخجه، از علل نسبتاً شایع آنسفالیت ثانویه محسوب میشوند. با توجه به گستردگی ایمنسازی بر علیه این بیماریها، امروزه موارد آنها بهندرت مشاهده میشود.