무엇이 자폐증을 일으키는가? 그것은 아직도 수수께끼로 남아 있다. 신경성인가? 생물학적 문제인가? 자궁 안에서의 충격인가? 모성애 부족인가? 혹은 미네랄 부족? 뇌장애? 심리적 유전? 많은 전문가들의 견해가 각각 다르다. 연구에 따르면 중추 신경계의 어느 한 부분이 적절히 발달하지 못했기 때문이라고 한다. 알 수 없는 이유들로 인해 뇌 속에서 자라고 있는 수많은 신경들이 서로 잘못 연결된 것이다. 연구자들은 자폐증의 조건을 가진 독서 장애 난독증 환자의 뇌 연구를 통해 그들의 신경들이 잘못된 방향으로 자라고 있음을 밝혀냈다. 정밀 뇌파 검사기를 이용한 여러 연구 보고에 의하면 상당수 자폐인들은 신경계 발달에 이상이 있고 뇌의 어떤 부분이 과잉 반응을 한다는 것을 알 수 있다. 중요한 사실은 자폐증의 종류에 상관없이 그 증후들이 거의 같다는 것이다.
