Según estudios realizados por arqueólogos, estiman que estas construcciones fueron realizadas en el siglo XV por la civilización Inca, pero su función estructural aun sigue siendo un misterio. Se supo que estuvo habitada por una gran cantidad de habitantes pero solo por sacerdotes y por "aqllas" que significan "Virgenes del sol".
La ciudad esta conformada por 3 áreas: 2 zonas pobladas y 1 zona agricola.
El sector poblado estaba dividido en dos barrios, en uno de ellos se encuentran los templos más importantes como el del Sol, así como la recámara real.
En los años de 1440 el primer emperador Inca llamado "Pachacuteq" conquisto las tierras de Machu Picchu, no fue hasta el año 1450 donde mando construir un complejo urbano con edificaciones civiles y religiosas de gran lujo como refugio de lo más selecto de la aristocracia incaica, un lujoso y bien cuidado mausoleo para recibir los restos del monarca Pachacutec.
La fortaleza fue ubicada en la vertiente oriental de la cordillera del Vilcanota, una visita al corazón del Imperio Inca y la cultura andina y colonial.
Se cree que la población en Machu Picchu fue entre 300 y 1000 habitantes pertenecientes a la panaca de Pachacuteq, era un lugar desconocido para las castas inferiores y sus rutas prohibidas para cualquiera que no formara parte del pequeño círculo del Inca.
Dentro de los valles que formaban la región del valle se encuentran los centros administrativos de Patallacta y Quentemarca los cuales favorecían a Machu Picchu por sus sectores agrícolas y así brindaban alimentos a la población.
Al morir Pachacuteq todas sus propiedades pasaron a ser administradas por su panaca y comenzó un nuevo gobierno del inca Túpac Yupanqui (1470-1493) y Huayna Capac (1493-1529).
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