Gazi Alemdar Gemi’si nin hikayesi I.Dünya savaşına dayanır. I.Dünya Savaşı başladığı sırada, ülkemizdeki kömür işletmelerinin işletme hakkı müttefiğimiz Almanya’ya verilmiştir.
Ancak Ruslar bu olaya çok kızarlar. Tepki olarak Ereğli kıyılarını iki yıl süreyle aralıksız bombardımana tutarlar. Haliyle sürenin uzamasıyla olaylar, Kurtuluş Savaşı’nın yaşandığı zamana denk gelmektedir.
Bu olaylar yaşanırken İstanbul işgal altındadır. Bir grup vatansever bu gemiyi İstanbul'dan kaçırıp Karadeniz Ereğli limanına getirilir.
Limana demir alan gemiyi görüp kızan Fransızlar, hastaneler de dahil olmak üzere tüm Ereğli kıyılarını bombardımana tutarlar. Ancak Ereğli halkının mücadelesi karşısında kenti işgal edemezler.
İşgal esnasında gemiyi kaçıran vatanseverler, gemiyi gizlice denize çıkarıp Fransızları bozguna uğratırlar. Fransız asker ve komutanlarını esir alırlar.
Sonrasında bir anlaşma imzalanır. Bu anlaşma Türkiye Devleti olarak Kurtuluş Savaşı esnasında imzalanan ilk uluslararası anlaşma olması açısından önemlidir. Bu sebeple bu gemiye gazi ünvanı verilip müze olarak hizmete açılmıştır.