মূল নিবন্ধ: ক্র্যানিয়াল স্নায়ু নিউক্লিয়াস
বেশিরভাগ স্নায়ু স্নায়ুগুলির নিউরনগুলির বেশিরভাগ অংশ মস্তিষ্কে এক বা একাধিক নিউক্লিয়ায় থাকে। এই নিউক্লিয়াসটি ক্র্যানিয়াল স্নায়ু রোগের গুরুত্বপূর্ণ আপেক্ষিক কারণ স্ট্রোক বা ট্রমা থেকে এই নিউক্লিয়াসের ক্ষতি একটি ক্র্যানিয়াল স্নায়ুর এক বা একাধিক শাখাগুলিকে ক্ষতিগ্রস্ত করে তুলতে পারে। নির্দিষ্ট ক্র্যানিয়াল স্নায়ু কেন্দ্রীয় পদার্থের মধ্যে, মস্তিষ্কের মধ্যবিন্দুতে অকলোকোটর স্নায়ু (III) এবং ট্রোচলায়ার স্নায়ু (চতুর্থ) এর নিউক্লিয়াস থাকে; প্যান্সে ট্রাইগমেনাল স্নায়ু (ভি), অ্যাডডিসেন স্নায়ু (ছয়), মুখের স্নায়ু (সপ্তম) এবং ওয়েস্টিবুলকোক্লায়ার স্নায়ু (8) এর নিউক্লিয়াস রয়েছে; এবং মস্তিষ্কে গ্লসোফার্নিজাল স্নায়ু (আইএক্স), ভ্যাগাস স্নায়ু (এক্স), অক্সিজেন স্নায়ু (একাদশ) এবং হাইপোগ্লাসাল স্নায়ু (1২) এর নিউক্লিয়াস রয়েছে। এই ক্রান্তীয় স্নায়ুগুলির ফাইবারগুলি এই নিউক্লিয়াস থেকে মস্তিস্ক থেকে বেরিয়ে আসে। [1]