Bu camiyi ilk gördüğümde nasıl oldu bilmiyorum minareyi fark etmemişim ve nasıl da kiliseye benziyor demiştim.
Sonradan öğrendim ki Fethiye Camii, eski bir Bizans kilisesinin camiye çevrilmiş haliymiş.
Bizans İmparatoru Phocas, kızı Helena için 7.yy. da bu kiliseyi yaptırmış. Danişmentliler döneminde ise Amasya Valisi Fetih Gazi, bu büyük kiliseyi camiye çevirerek ismini Fethiye Camii olarak değiştirmiştir.
Caminin zamanla çok hasar almasından dolayı 1956 yılında onarılmış ve tekrar ibadete açılmıştır. Yakın zamanda da 2006 yılında restore edilmiştir.
Kilise camiye ilk çevrildiğinde haliyle minaresi bulunmamaktadır. Caminin minaresi 1883 yılında İncezade Hacı Mehmet tarafından eklenmiştir.
