其水中的生活环境为无数鸟类和爬行动物以及美洲鳄、海牛、佛罗里达黑豹一类的濒危动物提供了合适的避难场所，曾面临灭绝危机的美洲短吻鳄如今正在这里繁衍生息，园内栖息有300多种鸟类。这些陆生和水生动植物群落相互适应，并且也适应了这里夏天湿润、冬天干燥的气候，形成了良性循环的自然生态系统。
1979年联合国教科文组织将其评为世界自然遗产。但是，周围的城乡发展建设，对这里的原生态自然环境破坏很大，流向国家公园的水被高高的水坝和无数的灌渠截流，一半的原始湿地因此而干涸，没有了水流，许多动植物将遭遇灭顶之灾。
所以，在1993年12月大沼泽地国家公园又被列入濒危的世界遗产名录中。数十年来，科学家们正在寻求新的途径来重建自然水流以满足大沼泽地环境的需要，这个国家公园在被保护方面拥有最优越的人、财、物实力，受到了史无前例的重视。
对大沼泽的保护不仅仅是环境或是世界遗产的保护，它同时还是对当地主要淡水资源的保护，这是健康的海洋和河口环境的关键所在，公园还是以环境旅游业为生的当地人们的衣食来源，所以对公园的保护不仅具有科学上的意义，还具有经济意义。2007年6月26日第31届世界遗产大会鉴于其保护工作卓有成效，终于将美国大沼泽地国家公园从“濒危”世界遗产名单上去除了。
